Laboratoře ArcheoGen
Výzkum a analýzy starobylých biomolekul probíhá ve vysoce specializovaných laboratořích určených výhradně pro tyto účely.
DNA i další biomolekuly (proteiny, lipidy) mají schopnost za vhodných podmínek perzistovat i tisíce let, po celou dobu však podléhají degradaci, která má za následek nezvratné poškození na všech úrovních molekuly. Následem poškození se starobylá DNA účastní analýz mnohem méně ochotněji než současná DNA a případná kontaminace moderní DNA tak výrazně komplikuje analýzy. Z tohoho důvodu je nutné dodržovat systém protikonataminačních opatření, který je závazný pro všechny pracoviště, které se aDNA zabývají.
ArcheoGen laboratoře jsou rozděleny do dvou fyzicky separovaných pracovišť. Vzorkovací laboratoře se nachází v suterénu Ústavu archeologie a muzeologie,FF (ÚAM). Molekulárně genetické laboratoře jsou součástí výzkumné infrastrukury MUNI BioPharma Hub v Univerzitním kampusu v Bohunicích.
ArcheoGen v ÚAM
V suterénu Ústavu archeologie a muzeologie FF MU se nacházejí labotaroře pro pre-PCR analýzy vzorku a skladovací prostory. Vstup do těchto prostor je limitová pro odborníky z řad zaměstnanců ArcheoGen. V pre-PCR laboratořích probíhá fotodokumentace přivezených nálezů, jejich očištění, popis a dekontaminační procesy. Pro analýzu aDNA jsou odebírány zuby nebo kosti skalní. Po opakovaném ošetření UVC zářením následuje podrobná fotodokumentace a poté je tkáň rozmělněna vrtákem na jemný prach a alikvotována do mirkozkumavek - vzorek je připravem na molekulárně biologickou část analýzy.
ArcheoGen v UKB
ArcheoGen laboratoře budou součástí nové infrastruktury Masarykovy univerzity MUNI BioPharma hub, která se buduje jako zázemí pro propojení výzkumu a vzdělávání. BioPharma Hub je situována v Univerzitním kampusu Bohunice. Nově vzniklé laboratoře ArcheoGen budou zázemím pro molekulárně biologické analýzy starobylé DNA, od extrakce DNA, přes shot gun sekvenování, celogenomové sekvenování až sběr a uchování získaných dat pro bioinformatickou analýzu. Stavba by měla být dokončena v dubnu 2026. Zahájení provozu včetně výuky je naplánováno na podzim 2026.
https://www.idps.cz/cz/biopharma-hub-masarykovy-univerzity