„Čas v DNA, DNA v čase.“

ArcheoGen je vědecké centrum zkoumající starobylé biomolekuly. Analyzujeme zejména genetickou informaci z archeologického a historického materiálu – starobylou DNA (ancient DNA; dále aDNA).

Nejčastěji se v ArcheoGen zaměřujeme na lidskou aDNA. Jejím zdrojem jsou především kosterní nálezy a pozůstatky. Nejlépe a nejdéle se aDNA zachovává v zubech, kosti skalní, která je součástí spánkové kosti a v ušních kůstkách (kladívko, kovadlinka, třmínek) uložených ve středoušní dutině. Pro všechny uvedené zdroje skeletu platí, že jsou za života silně vaskularizované, během tafonomických procesů dobře chráněné a během manipulace vykazují nižší riziko kontaminace současnou DNA.

Svou pozornost cílíme na celý genom, tedy jadernou DNA i dědičnou informaci ukrytou v malých organelách, mitochondriích. Buď aplikujeme metodu "targed enrichment" - cíleného obohacení více než milionu klíčových polymorfních lokusů nebo, v případě dobrého zachovalosti DNA, přistupujeme k celogenomovému čtení.

V ArcheoGen se věnujeme také analýze DNA patogenů a patologií. Ruku v ruce s evolucí a historií člověka šla také evoluce lidských nemocí. DNA vybraných infekčních agens a parazitů může perzistovat společně s lidskou DNA a díky tomu je možné v historických tkáních analyzovat souběžně. Získané informace nám pomáhají ještě více rozšířit znalosti a představit o životě v minulosti.

ArcheoGen v současnosti svou činnost rozšiřujeme také o analýzu aDNA zvířat a rostlin, sedimentární DNA (sedaDNA) ​a paleoproteomiku.